Alunos e docentes da UFPR tem reclamado de diversos problemas na universidade, tal como tamanho das salas de aula em comparação ao número de alunos, falta de laboratórios e de salas de estudo.

Pelo menos 4 setores da UFPR, que englobam vários cursos, padecem com a falta de estrutura física que garantam a qualidade de ensino e o bem-estar do professor e do aluno em sala de aula. Cursos das áreas de Letras, Ciências Humanas, Ciências Sociais Aplicadas, Exatas, Artes e Educação Profissional e Tecnológica são alguns dos mais afetados. O problema atinge tanto os programas de graduação quanto os de pós-graduação da Universidade.

Tal problema já é antigo na universidade, mas se agravou com a entrada no Programa de Reestruturação e Expansão das Universidades Federais (Reuni), em 2007. Uma das visões do programa é o aumento da taxa de conclusão média em cursos presenciais e a elevação da relação professor/aluno. O Reuni também previa disponibilidade de gastos para melhorar a estrutura com o aumento do número de vagas, mas a situação não mudou.

A maioria das obras na Universidade supre antigas necessidades dos docentes e alunos e as novas demandas, que aparecem com o Programa, não são atendidas. Até mesmo os cursos criados com o Reuni estão passando por dificuldades, sem estrutura para as aulas ou laboratórios para pesquisa, como o curso de Tecnologia em Aquicultura, no Centro de Estudos do Mar da UFPR (CEM), em Pontal do Paraná. As duas primeiras turmas do curso, criado em 2009, estudam sem laboratórios de aulas práticas.